目前電動自行車使用的電池品種不少。除了使用量最大的閥控密封式鉛酸蓄電池以外，還有鎳氫電池、鎳鎘電池、鋰離子電池、聚合物鋰電池、鋅空電池、燃料電池等等。其中，以鉛酸蓄電池為數量最多。鉛酸蓄電池的價格最低，也最常用，中國是全世界鉛酸蓄電池最大的生產國。其含污染的成分比較少，可回收性好。缺點是比容小。也就是說，在同樣的容量下，電池重量和體積都大。目前的鉛酸蓄電池基本上是由浮充類型的電池發展而來的。浮充電池不適應快速充電和大電流放電，雖然技術人員的花費了大量的心血進行了卓有成效的改進，可以進入實用了，但是其壽命還是非常不理想的。
鎳氫電池的比容比鉛酸蓄電池好很多，單體電池的壽命也比較好，其大電流充放電特性也比鉛酸蓄電池好。問題是鎳氫電池串連電池組的管理問題比較多，一旦發生過充電以后，就會形成單體電池隔板熔化的問題，導致整組電池迅速失效。所以，國產的鎳氫電池的關鍵技術問題還是充電器和電池管理系統的問題，而這個問題還沒有引起各個電池制造商和車廠足夠的重視。
所以，鎳氫電池的發展收到很大的制約。鎳鎘電池的大電流特性比鎳氫電池好，其抗過充電特性也比鎳氫電池好，中國又是世界上鎳鎘電池的生產大國。一些人提出鎘污染的問題，中國現在還在大量的向歐洲出口鎳鎘電池及其應用產品，歐洲到2006年才開始限制。
選購電動自行車電池，一要查看產品標志是否齊全，包括制造廠名、產品規格型號、制造日期、商標；查看內外標志是否一致，尤其要檢查產品是否有醒目標志，生產日期要注意是否在近期。二要注意電池的外觀。查看產品是否有變形、裂紋、劃痕及漏液痕跡。電池接線端子上應干凈，無銹蝕，標志應清晰。三是關注電動車電池產品標注的額定容量。電池標注的額定容量越大，電池放電時間越長，最好不要購買無額定標注的電池，但要注意是否為電動車專用，如有多個容量標注，應以額定容量為準。四是要選購知名企業、大型企業的品牌電池。電池一般由專業電池生產廠提供，不同品牌、不同廠家生產的電池質量有優劣之別，價格也有高低之分。知名、大型企業規模大，技術強，售后服務好，電池質量有保證。
延長電動車電池的使用壽命的做法：一要電動車上用的鉛酸電瓶最怕虧電，有條件的時候，最好是停車后就立即把用去的電量補充上，長期不用也要每隔20-30天充一次電；二要在騎行途中如果感到電已用完，千萬不要等一會又接通使用，微存在電瓶里的那點電是電瓶的保命電，如果繼續停開使用救命余電，對電瓶壽命影響極大；三要隨車帶的充電機，一般都有浮充功能，只要每次充電時間在12小時內，對電瓶基本是利大于弊。只要注意以上三點，保證你的電瓶使用壽命達到良好狀態。
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